La Barbastelle est une espèce typiquement forestière. Chauve-souris méridionale, elle supporte néanmoins très bien le froid en période d’hibernation et le climat tempéré doux du pied du Jura lui convient très bien en été. Elle préfère les forêts de feuillus matures où elle chasse presque exclusivement des papillons tympanés (géométridae).
Ses gîtes sont principalement arboricoles avec une préférence pour les étroits espaces situés sous les écorces décollées des arbres morts. On la retrouve également derrière les volets, où elle utilise le même type d’interstices étroits.
Malgré deux études ciblées, aucune colonie de mise-bas n’a pu être découverte dans le canton de Neuchâtel. La présence de femelles dans la région du Plan Jacot à Bevaix laisse tout de même penser à une reproduction dans ce secteur. La plus grande population connue dans le canton est située dans les Gorges de l’Areuse.
Espèce proche: aucune